MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidimicrobidae bacterium YM16-304 DNA

Total Repeats: 7684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020520	GATC	2	8	220242	220249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_020520	GGAT	2	8	220797	220804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020520	GAAG	2	8	220839	220846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020520	GCG	2	6	222050	222055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_020520	TCG	2	6	222087	222092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_020520	CTC	3	9	222106	222114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_020520	GAA	2	6	222131	222136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020520	GAGC	2	8	222609	222616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_020520	GAC	2	6	223003	223008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_020520	GCC	2	6	223014	223019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_020520	TCGC	2	8	223044	223051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
512	NC_020520	CGG	2	6	223056	223061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020520	GTC	2	6	223715	223720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020520	CGGT	2	8	223727	223734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_020520	CGATG	2	10	229028	229037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
516	NC_020520	GC	3	6	229040	229045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_020520	CCA	2	6	229071	229076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_020520	CGG	2	6	229094	229099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_020520	CGT	2	6	231318	231323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020520	GCC	2	6	231340	231345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_020520	CGG	2	6	231360	231365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_020520	CGC	2	6	231454	231459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_020520	GTG	2	6	231535	231540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020520	C	6	6	233065	233070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
525	NC_020520	ATC	2	6	233080	233085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020520	ATG	2	6	233102	233107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020520	GCC	2	6	237469	237474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_020520	CGCGC	2	10	237508	237517	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
529	NC_020520	C	6	6	237615	237620	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
530	NC_020520	TTC	2	6	237655	237660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020520	GTAA	2	8	237704	237711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020520	GCC	2	6	237822	237827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_020520	GC	3	6	237835	237840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_020520	TCAG	2	8	238481	238488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_020520	GAG	2	6	238505	238510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020520	GTC	2	6	239377	239382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_020520	GGA	2	6	239423	239428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020520	TCG	2	6	239429	239434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_020520	GTC	2	6	240284	240289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020520	TCG	2	6	242845	242850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020520	ATG	2	6	242906	242911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020520	TCA	2	6	242913	242918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_020520	ACG	2	6	242953	242958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_020520	AGT	2	6	242959	242964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020520	CCG	2	6	242989	242994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_020520	CCCGA	2	10	246714	246723	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
547	NC_020520	CCG	2	6	246794	246799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_020520	TGTC	2	8	246817	246824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_020520	GTG	2	6	246863	246868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020520	CG	3	6	246908	246913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_020520	CCA	2	6	246928	246933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_020520	ACA	2	6	246937	246942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020520	TCG	2	6	247298	247303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_020520	ACC	2	6	247340	247345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_020520	TGG	2	6	247397	247402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020520	GCC	2	6	249253	249258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_020520	TTC	2	6	249331	249336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_020520	ACGG	2	8	249351	249358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
559	NC_020520	C	6	6	249479	249484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
560	NC_020520	GTCG	2	8	249533	249540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
561	NC_020520	CGC	2	6	249552	249557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_020520	CGA	3	9	254157	254165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_020520	TTG	2	6	254178	254183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020520	TAG	2	6	254196	254201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020520	GAT	2	6	254253	254258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020520	GACC	2	8	256660	256667	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
567	NC_020520	ACTG	2	8	258252	258259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_020520	GATG	2	8	258265	258272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020520	GGT	2	6	258280	258285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020520	CGT	2	6	258301	258306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_020520	CGC	2	6	259279	259284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_020520	GC	3	6	259296	259301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_020520	ACA	2	6	259344	259349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_020520	GTA	2	6	259375	259380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020520	ACG	2	6	259404	259409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_020520	CAC	2	6	260340	260345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_020520	TCG	2	6	260354	260359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_020520	TCG	2	6	260378	260383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_020520	TCGC	2	8	263438	263445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_020520	CGT	2	6	267168	267173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_020520	ACG	2	6	267175	267180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_020520	GGA	2	6	267204	267209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020520	TGA	2	6	267210	267215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020520	GCCACT	2	12	267254	267265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
585	NC_020520	ACT	2	6	267267	267272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_020520	TGACG	2	10	267323	267332	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
587	NC_020520	GTGTCG	2	12	267340	267351	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
588	NC_020520	CG	3	6	267398	267403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_020520	CG	3	6	267410	267415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_020520	GTG	2	6	269584	269589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020520	GCG	3	9	269615	269623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_020520	CCGG	2	8	269624	269631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_020520	TCG	2	6	271237	271242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020520	CGG	2	6	271252	271257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020520	CGT	2	6	272339	272344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_020520	GAA	2	6	272362	272367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020520	GCA	2	6	272402	272407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_020520	TC	3	6	272417	272422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_020520	TCC	2	6	275068	275073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_020520	GCC	2	6	275108	275113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_020520	CCG	2	6	275120	275125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_020520	GCG	2	6	276830	276835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_020520	GCCG	2	8	277746	277753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_020520	CGCTG	3	15	277763	277777	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
605	NC_020520	CGA	2	6	278667	278672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_020520	ACG	2	6	278675	278680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_020520	CGGG	2	8	278692	278699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
608	NC_020520	GCCGA	2	10	278840	278849	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
609	NC_020520	GACGGC	2	12	279013	279024	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_020520	TCGT	2	8	279043	279050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
611	NC_020520	GAC	2	6	279052	279057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_020520	CGTG	2	8	279094	279101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
613	NC_020520	TCG	2	6	279186	279191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_020520	ACG	2	6	279222	279227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_020520	GAC	2	6	279252	279257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_020520	CT	3	6	280919	280924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_020520	GC	3	6	280929	280934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_020520	CGG	2	6	280995	281000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_020520	TTTC	2	8	281013	281020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_020520	TGC	2	6	281081	281086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_020520	GCCGC	2	10	282558	282567	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
622	NC_020520	AGC	2	6	282568	282573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020520	CCCG	2	8	282587	282594	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
624	NC_020520	GC	3	6	282626	282631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_020520	CGC	2	6	284619	284624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_020520	GGT	2	6	285155	285160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020520	GTG	3	9	285508	285516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020520	TC	3	6	286717	286722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_020520	ACA	2	6	286762	286767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_020520	CGG	2	6	292350	292355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020520	CCG	2	6	292364	292369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_020520	CCGAG	2	10	292393	292402	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
633	NC_020520	CGGA	2	8	292420	292427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_020520	AGC	2	6	292443	292448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_020520	GTG	2	6	294301	294306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020520	GCT	2	6	296002	296007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_020520	AAC	2	6	296016	296021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_020520	AGA	2	6	296069	296074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020520	GATG	2	8	296191	296198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020520	AAG	2	6	296234	296239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020520	TCG	2	6	299031	299036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_020520	GC	3	6	299067	299072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
643	NC_020520	GGA	2	6	299091	299096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
644	NC_020520	TCGT	2	8	299105	299112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
645	NC_020520	CTG	2	6	299114	299119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_020520	ACGA	2	8	299151	299158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
647	NC_020520	GCT	2	6	299170	299175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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653	NC_020520	TCCCTC	2	12	299392	299403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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661	NC_020520	CGA	2	6	301119	301124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_020520	CGT	2	6	304543	304548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_020520	CCG	2	6	305057	305062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
674	NC_020520	GTC	2	6	305105	305110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_020520	CGA	2	6	377260	377265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_020520	GCA	2	6	377319	377324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
774	NC_020520	GGCG	2	8	377347	377354	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
775	NC_020520	CGA	2	6	377356	377361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_020520	GGCG	2	8	377382	377389	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
777	NC_020520	CGA	2	6	377391	377396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
778	NC_020520	GCA	2	6	377450	377455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_020520	CGA	2	6	377487	377492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_020520	GGCT	2	8	378471	378478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
781	NC_020520	GTCCG	2	10	378511	378520	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
782	NC_020520	GCC	2	6	378537	378542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
783	NC_020520	CCGTTG	2	12	379956	379967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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785	NC_020520	GCG	2	6	381458	381463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_020520	CG	3	6	381462	381467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
787	NC_020520	GT	3	6	383358	383363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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789	NC_020520	GGT	2	6	387996	388001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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791	NC_020520	GGT	2	6	388029	388034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
792	NC_020520	CGG	2	6	388081	388086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
793	NC_020520	TCG	2	6	391529	391534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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796	NC_020520	GCG	2	6	393503	393508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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799	NC_020520	TCG	2	6	393553	393558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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803	NC_020520	GAA	2	6	395088	395093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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805	NC_020520	GA	3	6	396325	396330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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809	NC_020520	CGC	2	6	399780	399785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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899	NC_020520	GGT	2	6	469678	469683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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901	NC_020520	TA	3	6	471070	471075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
902	NC_020520	CGA	2	6	471103	471108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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904	NC_020520	TG	3	6	477547	477552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
905	NC_020520	AC	3	6	478959	478964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
906	NC_020520	GGGGA	2	10	479571	479580	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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909	NC_020520	TGA	2	6	480614	480619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
910	NC_020520	CTGCG	2	10	480624	480633	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
911	NC_020520	AACAGC	2	12	480655	480666	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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913	NC_020520	TGG	2	6	481896	481901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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915	NC_020520	TGA	2	6	482822	482827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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932	NC_020520	CAC	2	6	492173	492178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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944	NC_020520	GCC	2	6	495402	495407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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947	NC_020520	ACG	2	6	495444	495449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
948	NC_020520	CGGG	2	8	495467	495474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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951	NC_020520	CCG	2	6	496831	496836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
952	NC_020520	GTTCG	2	10	496843	496852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
953	NC_020520	CCGCT	2	10	500004	500013	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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